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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  30 lines
  1. *****************************************************************
  2. * Dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratases signatures *
  3. *****************************************************************
  4.  
  5. Two bacterial dehydratases have been shown [1] to be evolutionary related:
  6.  
  7.  - Dihydroxy-acid  dehydratase  (EC 4.2.1.9)  (gene ilvD)  which catalyzes the
  8.    fourth step in the biosynthesis of isoleucine and valine, the dehydratation
  9.    of 2,3-dihydroxy-isovaleic acid into alpha-ketoisovaleric acid.
  10.  - 6-phosphogluconate dehydratase (EC 4.2.1.12) (gene edd) which catalyzes the
  11.    first step in the Entner-Doudoroff pathway, the dehydratation of 6-phospho-
  12.    D-gluconate into 6-phospho-2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate.
  13.  
  14. Both enzymes  are  proteins  of about 600 amino acid residues. We selected two
  15. highly conserved  regions  as signature patterns. The first pattern is located
  16. in the N-terminal part while the second is from the C-terminal half.
  17.  
  18. -Consensus pattern: C-D-K-x(2)-P-G-x(3)-[GA]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21.  
  22. -Consensus pattern: A-L-[LIVM]-T-D-G-R-[LIVMF]-S-[GA](2)-[ST]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Last update: October 1993 / First entry.
  27.  
  28. [ 1] Egan S.E., Fliege R., Tong S., Shibata A., Wolf R.E. Jr., Conway T.
  29.      J. Bacteriol. 174:4638-4646(1992).
  30.